1、管理基礎薄弱
推行六西格瑪需要企業做好充分的準備，國外很多先進企業有著上百年的歷史，它們在目標管理、人力資源管理、過程管理方面積累了豐富的經驗，它們在推行六西格瑪之前已經完成了流程再造，定義了核心業務流程的起點、終點和工作量化目標，六西格瑪只是起到了對原有流程的改進作用。而我們的國內制造業只有幾十年的歷史，它們在應用六西格瑪之前要把更多的精力放在公司業務流程的梳理、職業經理人素質的“惡補”和數據采集體系的完善上，難度較大。
2、很多制造企業的管理層缺乏質量理念的支撐
20世紀80年代曾轟轟烈烈地學習日本的TQM, 90年代忙于IS09000質量認證，企業間存在著嚴重的明顯的從眾跟風行為，質量管理的形式主義泛濫，質量管理的出發點不是基于顧客滿意，也沒有正確地運用質量管理工具，對質量改進缺乏持續性。企業難以形成良好的企業文化，管理層對質量工作的推動力度不夠，質量目標、指標及考核方式不健全甚至不合理，在產量與質量發生矛盾時，重產量輕質量，不能正確處理長期利益和短期利益的關系。
3、缺乏明確目標，重形式，輕效果
目前，很多企業的質量管理體系基本是按照IS09000的要求建立的，不是結合企業實際的需要，而是照搬IS09000的要求，一旦通過認證，便認為企業的質量管理水平有了很大提高，缺乏對顧客需求的關注，缺乏持續改進的動力。相當一部分企業之所以進行IS09000質量管理體系認證，主要是因為客戶采購時要求供應商必須通過認證，提高企業的質量水平的意識并不強烈，缺乏對質量的深刻認識，缺乏質量管理方法的指導。盡管有些企業有強烈的質量意識，但缺乏先進質量理念的指導，質量工作具有很大的盲目性。
4、對六西格瑪流程的認識不足
許多企業認為DMAIC流程不過是統計方法的運用，作用有限，解決不了大問題。如果企業的高層領導對六西格瑪DMAIC流程的認識停留在這一層面上，沒有哪個企業的領導會在這方面花費實踐和精力。只有企業高層領導真正從戰略高度認識到了六西格瑪的價值，六西格瑪的應用才有可能成為現實。
5、20年前全面質量管理的陰影
國家經委曾經以運動的方式向國有企業推廣全面質量管理，結果是來的快去的也快。這個形式主義的陰影至今在許多國有企業還沒有完全消除，他們擔心同樣作為一種質量管理法的六西格瑪也是“一陣風”，很難取得預期的效益。目前很多企業的CEO們都聽說過六西格瑪在GE公司所取得的成功，它能幫助企業取得突破性成果，于是把六西格瑪當作一次質量運動，跟風似的走上了六西格瑪之路。但是對六西格瑪理念和推進方法缺乏必要的認識，六西格瑪活動成為質量部門的工作，針對局部問題應用六西格瑪工具進行改善，結果發現效果遠遠不如當初想象的那么好，于是認為六西格瑪不適合本公司，有在追尋另一種途徑。
6、統計技術的運用薄弱
在我國質量管理發展歷程中，幾乎是跨越了統計技術階段，統計技術的運用成為制造業一個非常薄弱的一個環節。無論是在貫徹IS09000標準還是在企業的其它質量改進方面，許多企業都希望提高統計技術的應用水平。
7、缺乏對信息管理系統的投入
在六西格瑪流程應用過程中，許多統計技術的運用必須借助專業的統計軟件才能完成。許多制造企業在信息管理系統的建設方面明顯投入不足，認為本企業還不需要在這方面進行投入，認為這類投資很難得到回報，因而缺乏投資的積極性。即使有些企業認為可以嘗試推進六西格瑪，也因為現有的系統無法支持，遲遲不能進行，只好束之高閣。
